Las proteínas tienen muchos aminoácidos diferentes como sus monómeros. Debido a diferentes factores como la interacción hidrofóbica, los enlaces de hidrógeno, la fuerza de Van der Waals, la introstracción electrostática, los enlaces di-sulfuro y los enlaces covalentes, suponen muchas conformaciones. Se pliegan de diferentes maneras para lograr estabilidad y llevar a cabo varias reacciones enzimáticas.
Por otro lado, los carbohidratos no son tan complejos. Contienen una unidad repetitiva del mismo monómero o dímero o pueden tener diferentes unidades de monómero unidas entre sí. No tienen ningún rol enzimático (pueden tener).
Las proteínas con la combinación de más de 20 aminoácidos pueden unirse entre sí mediante un enlace peptídico y pueden ser moléculas muy grandes, como la titina (que se encuentra en los músculos, aproximadamente 27000 aminoácidos) o pueden ser pequeñas, como la insulina o las buenas prácticas agrarias. Por lo tanto, las proteínas son más diversas que los carbohidratos.