¿Por qué los polisacáridos no se pliegan en conformaciones específicas como lo hacen los polipéptidos?

Ambos polipéptidos y polisacáridos son cadenas poliméricas. Dependiendo del equilibrio entre la auto interacción, la interacción con el solvente y los efectos entrópicos, ambos exploran estados ordenados / plegados y conformaciones desordenadas de tipo espiral aleatorias. Sin embargo, los polipéptidos tienen una mayor heterogeneidad química que los hace más adecuados para las funciones enzimáticas.

  • Los aminoácidos tienen químicas muy diferentes, desde grados de polaridad hasta distribuciones de carga hasta hidrofobicidad. Cuando unes varios aminoácidos diferentes, hay múltiples interacciones competitivas. Ahora, agregue un solvente favorable, el equilibrio entre las interacciones inter e intramoleculares y los efectos entrópicos pueden impulsar una cadena polipeptídica a plegarse.
  • Sin embargo, esto no siempre sucede. Por eso leemos sobre proteínas intrínsecamente desordenadas y su presencia significativa en eucariotas.
  • Si toma una cadena polipeptídica hecha de alanina o glicina o un residuo particular, es posible que se doblen en condiciones muy específicas y permanezcan desplegados o agregados en la mayoría de los diferentes solventes y condiciones.
  • De manera similar, hay muchos tipos diferentes de polisacáridos en la naturaleza, y muchos estudios de rayos X muestran que múltiples cadenas de polisacáridos forman hélices. [1]

Figura 1: Curdlan y Schizophyllan son conocidos por adoptar conformaciones de triple hélice. [2]

Figura 2: representación esquemática de cintas y un agregado de cinta ( izquierda ), como se encuentra en la celulosa, y de una hélice ( derecha ), como se encuentra en el almidón. Los enlaces de hidrógeno están representados por líneas rojas discontinuas [3]

Notas a pie de página

[1] Estudios de difracción de rayos X de sulfatos de polisacáridos: modelos de doble hélice para κ- y ι-carragenanos

[2] Página en rsc.org

[3] Polisacáridos para la administración de fármacos antitumorales

Asumiría por la misma razón que los lípidos y los esteroides no. Tienden a ser simplemente hidrocarburos y carecen de los grupos funcionales únicos necesarios para realizar catálisis más avanzada.

Para las enzimas, a menudo el nitrógeno es un átomo muy valioso en un sitio activo; sus electrones no apareados pueden estabilizar una carga positiva durante el estado de transición.

Esto es quimotripsina a continuación.

Por otro lado, si el oxígeno en un polisacárido estabilizara una carga positiva, particularmente en forma de un ion hidronio, veríamos hidrólisis catalizada por ácido en poco tiempo: