Las proteínas comienzan a hidrolizarse en el estómago pero terminan la descomposición en el intestino delgado. Mientras que las proteínas completas no pueden ser absorbidas, los fragmentos que combinan varios aminoácidos a menudo son absorbidos por el revestimiento intestinal. Excepto en la inflamación, la alergia o el síndrome del intestino permeable, solo los aminoácidos individuales llegan al torrente sanguíneo.
La sangre del intestino delgado pasa a través del hígado antes de alcanzar la circulación general. El hígado convierte aproximadamente la mitad de los aminoácidos en glucosa y urea. Eso significa que consumir suficiente proteína de digestión rápida puede elevar el azúcar en la sangre y requerir insulina. También significa que no hay una necesidad absoluta de consumir azúcar o almidón.
La otra mitad se convierte en músculo temporal. Simplemente no hay otro lugar para almacenar aminoácidos. Ese músculo generalmente se canibaliza mientras se espera la próxima comida. Por lo general, se convierte en glucosa y urea.
Las porciones grandes (más de 20 gramos) de proteínas solubles (como suero de leche) pueden salir del estómago y saturar el intestino delgado. Eso los empuja hacia el intestino grueso para ser fermentados por bacterias, lo que resulta en diarrea y gases.
Durante este proceso, una pequeña fracción de aminoácidos circulantes se utilizan para reconstruir proteínas estructurales o como materia prima para sintetizar otros productos químicos.