¿Hay algún software de análisis / estimación de la nutrición que cuente el tiempo de cocción, el método, la temperatura y otras variables para reflejar la pérdida de nutrientes en la preparación?

No, no que yo sepa. Sin embargo, USDA ha publicado rendimientos de cocción y factores de retención de nutrientes para ciertos alimentos y métodos de preparación. Creo que puedes encontrar esta información útil.