Phi es una rotación sobre el enlace Ca-N, Psi es una rotación sobre el enlace C-Ca.
Hay un tercer ángulo diedro, omega, que define la rotación del enlace N-C. El enlace NC tiene un carácter de doble enlace parcial debido a la posibilidad de resonancia del átomo de carbonilo: [1]
El doble enlace parcial restringe el enlace CN, lo que significa que omega suele restringirse a unos pocos grados [2] desde 180 ° (conformación trans, 99.7% de enlaces peptídicos) o 0 ° grados (conformación cis, 0.3% de enlaces peptídicos y 20% de enlaces de prolina). [3]
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Notas a pie de página
[1] CHEM 440 – Clase 9
[2] ¿Qué tan común es para los ángulos diedros omega tener un valor distinto de +180, -180 o 0 °?
[3] http://www.serc.iisc.ernet.in/~d…
